Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q3UPC7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Q3UPC7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q3UPC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q3UPC7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q3UPC7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q3UPC7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Q3UPC7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q3UPC7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Q3UPC7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Q3UPC7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q3UPC7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q3UPC7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q3UPC7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q3UPC7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3UPC7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms