Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rmdn3Q3UJU9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rmdn3Q3UJU9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms