Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnrc6cQ3UHC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms