Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frmd8Q3UFK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frmd8Q3UFK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frmd8Q3UFK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms