Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A930003A15RikQ3U552 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A930003A15RikQ3U552 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A930003A15RikQ3U552 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms