Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srsf6Q3TWW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srsf6Q3TWW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms