Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc10Q3TLI0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc10Q3TLI0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc10Q3TLI0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms