Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43aQ3TL54 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43aQ3TL54 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms