Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fubp3Q3TIX6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fubp3Q3TIX6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms