Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp444Q3TDV8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zfp444Q3TDV8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp444Q3TDV8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp444Q3TDV8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp444Q3TDV8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp444Q3TDV8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp444Q3TDV8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms