Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ1

Abraxas2, BRISC complex subunit Abraxas 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas2Q3TCJ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abraxas2Q3TCJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abraxas2Q3TCJ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abraxas2Q3TCJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abraxas2Q3TCJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms