Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Riiad1Q3KNY5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Riiad1Q3KNY5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms