Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lgQ1ERP8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300lgQ1ERP8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms