Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntnap5aQ0V8T9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntnap5aQ0V8T9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms