Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h18Q0P678 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h18Q0P678 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h18Q0P678 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms