Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssrp1Q08943 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssrp1Q08943 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssrp1Q08943 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssrp1Q08943 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms