Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tie1Q06806 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tie1Q06806 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tie1Q06806 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms