Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrx2Q06348 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrx2Q06348 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms