Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPINDOCQ05AH6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPINDOCQ05AH6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINDOCQ05AH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINDOCQ05AH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms