Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Caprin2Q05A80 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Caprin2Q05A80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Caprin2Q05A80 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms