Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddr1Q03146 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddr1Q03146 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms