Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fgfr4Q03142 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fgfr4Q03142 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgfr4Q03142 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgfr4Q03142 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms