Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ascl1Q02067 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ascl1Q02067 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl1Q02067 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms