Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
rp9P97762 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
rp9P97762 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
rp9P97762 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
rp9P97762 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
rp9P97762 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
rp9P97762 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
rp9P97762 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
rp9P97762 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
rp9P97762 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
rp9P97762 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
rp9P97762 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
rp9P97762 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
rp9P97762 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
rp9P97762 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
rp9P97762 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
rp9P97762 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
rp9P97762 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
rp9P97762 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
rp9P97762 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
rp9P97762 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
rp9P97762 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
rp9P97762 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
rp9P97762 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
rp9P97762 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
rp9P97762 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
rp9P97762 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
rp9P97762 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
rp9P97762 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
rp9P97762 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
rp9P97762 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
rp9P97762 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
rp9P97762 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
rp9P97762 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
rp9P97762 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
rp9P97762 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
rp9P97762 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
rp9P97762 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
rp9P97762 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
rp9P97762 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
rp9P97762 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
rp9P97762 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
rp9P97762 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
rp9P97762 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
rp9P97762 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
rp9P97762 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
rp9P97762 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
rp9P97762 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
rp9P97762 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
rp9P97762 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
rp9P97762 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms