Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tarbp2P97473 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tarbp2P97473 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tarbp2P97473 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms