Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bop1P97452 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bop1P97452 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bop1P97452 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bop1P97452 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bop1P97452 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bop1P97452 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bop1P97452 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms