Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cbx1P83917 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx1P83917 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms