Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptprn2P80560 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptprn2P80560 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptprn2P80560 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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