Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC44.19■■■■■ 4.67
Abcc9P70170 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
Abcc9P70170 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Abcc9P70170 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Abcc9P70170 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Abcc9P70170 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms