Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn5P68500 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn5P68500 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cntn5P68500 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntn5P68500 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms