Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb4bP68372 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb4bP68372 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms