Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SnrpfP62307 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SnrpfP62307 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms