Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nol4P60954 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nol4P60954 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nol4P60954 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nol4P60954 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nol4P60954 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms