Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap25P60879 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snap25P60879 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snap25P60879 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap25P60879 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snap25P60879 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snap25P60879 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snap25P60879 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snap25P60879 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snap25P60879 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms