Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims4P60191 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rims4P60191 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rims4P60191 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rims4P60191 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rims4P60191 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms