Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CgnP59242 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CgnP59242 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CgnP59242 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CgnP59242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CgnP59242 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CgnP59242 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CgnP59242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CgnP59242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CgnP59242 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CgnP59242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CgnP59242 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CgnP59242 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CgnP59242 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CgnP59242 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CgnP59242 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CgnP59242 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CgnP59242 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CgnP59242 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CgnP59242 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CgnP59242 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CgnP59242 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CgnP59242 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CgnP59242 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CgnP59242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CgnP59242 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CgnP59242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CgnP59242 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CgnP59242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CgnP59242 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CgnP59242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CgnP59242 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CgnP59242 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CgnP59242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CgnP59242 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CgnP59242 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CgnP59242 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CgnP59242 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CgnP59242 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CgnP59242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CgnP59242 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CgnP59242 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CgnP59242 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CgnP59242 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CgnP59242 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CgnP59242 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CgnP59242 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CgnP59242 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CgnP59242 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CgnP59242 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CgnP59242 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CgnP59242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CgnP59242 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CgnP59242 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms