Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn18P56857 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn18P56857 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn18P56857 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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