Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc4P54775 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc4P54775 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc4P54775 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms