Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fgd1P52734 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fgd1P52734 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms