Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox5P52651 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhox5P52651 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms