Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt6aP50446 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt6aP50446 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt6aP50446 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms