Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psen1P49769 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psen1P49769 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psen1P49769 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psen1P49769 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psen1P49769 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psen1P49769 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms