Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpcP49452 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CenpcP49452 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpcP49452 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpcP49452 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpcP49452 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CenpcP49452 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms