Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ercc3P49135 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ercc3P49135 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms