Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TfamP40630 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TfamP40630 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TfamP40630 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TfamP40630 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TfamP40630 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TfamP40630 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TfamP40630 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TfamP40630 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TfamP40630 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TfamP40630 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TfamP40630 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TfamP40630 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TfamP40630 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TfamP40630 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TfamP40630 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TfamP40630 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TfamP40630 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TfamP40630 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TfamP40630 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TfamP40630 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TfamP40630 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TfamP40630 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TfamP40630 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TfamP40630 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TfamP40630 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TfamP40630 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TfamP40630 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TfamP40630 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TfamP40630 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TfamP40630 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TfamP40630 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TfamP40630 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TfamP40630 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TfamP40630 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TfamP40630 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TfamP40630 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TfamP40630 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TfamP40630 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms