Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Chd1P40201 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chd1P40201 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Chd1P40201 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chd1P40201 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Chd1P40201 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Chd1P40201 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Chd1P40201 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Chd1P40201 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd1P40201 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chd1P40201 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms