Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk2P38575 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upk2P38575 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upk2P38575 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upk2P38575 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Upk2P38575 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms