Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Folr1P35846 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Folr1P35846 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Folr1P35846 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Folr1P35846 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Folr1P35846 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Folr1P35846 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Folr1P35846 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Folr1P35846 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Folr1P35846 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Folr1P35846 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms