Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab6aP35279 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab6aP35279 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms