Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SsbP32067 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SsbP32067 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SsbP32067 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SsbP32067 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SsbP32067 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SsbP32067 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SsbP32067 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SsbP32067 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SsbP32067 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SsbP32067 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SsbP32067 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SsbP32067 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SsbP32067 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SsbP32067 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SsbP32067 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SsbP32067 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SsbP32067 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SsbP32067 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SsbP32067 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SsbP32067 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SsbP32067 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SsbP32067 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SsbP32067 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SsbP32067 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SsbP32067 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SsbP32067 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SsbP32067 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SsbP32067 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SsbP32067 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SsbP32067 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SsbP32067 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SsbP32067 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SsbP32067 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SsbP32067 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SsbP32067 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SsbP32067 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SsbP32067 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SsbP32067 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SsbP32067 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SsbP32067 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SsbP32067 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SsbP32067 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SsbP32067 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SsbP32067 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SsbP32067 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SsbP32067 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SsbP32067 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SsbP32067 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SsbP32067 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SsbP32067 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SsbP32067 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SsbP32067 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SsbP32067 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SsbP32067 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SsbP32067 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SsbP32067 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SsbP32067 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SsbP32067 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SsbP32067 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SsbP32067 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SsbP32067 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SsbP32067 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SsbP32067 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SsbP32067 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209 ms